許多動物實驗都需要實驗動物在相對固定的條件下進行，例如活體成像、開顱的腦功能研究等。一般情況下，動物都不會配合這些實驗的開展，而且大部分的實驗操作還會伴有疼痛感，而麻醉和鎮痛技術為這些實驗的開展提供了可能。不同的實驗動物會因不同的生理屬性而影響麻醉劑的作用效率。與大動物（貓狗甚至更大）相比，小鼠的身體尺寸小，對藥物的代謝和排除更加迅速，降低了藥物的半衰期，也會影響麻醉藥物起效和維持的時間。

　　麻醉是一種無意識、鎮靜、肌肉松弛以及無反射的狀態。目前，按照作用藥物的種類可將麻醉分為注射式麻醉和吸入式麻醉。理想的麻醉劑應當具有易于操作、提供快速和充足的麻醉維持、沒有副作用、可以逆轉以及對動物和操作人員無害等特點。但是，這樣的麻醉劑并不存在，的麻醉選擇也需要根據不同實驗的需求來確定。

　　目前，阿佛丁是小鼠實驗中常用的注射類麻醉劑，它們經常會與諸如乙酰丙嗪、甲苯噻嗪、安定和一些鎮靜類藥物聯合使用；而異氟烷、地氟烷是吸入式麻醉中常用的麻醉劑。相比注射式麻醉，吸入式麻醉具有以下優點：（1）應用范圍廣，更加安全，尤其是針對深入和長時程麻醉實驗；（2）心臟保護功能，提高肺部的免疫力；（3）吸入和消除都在肺部，極少被吸收，不會產生肝腎毒性；（4）蘇醒快，適于短期麻醉，也利于更改麻醉策略，精確調控麻醉深度。與之相對的是，注射麻醉除了一些顯而易見的優點外，其還存在著一些缺點：（1）選擇一個合適的麻醉劑量是十分困難的，尤其是在不同麻醉劑的組合使用中，需要大量的摸索嘗試；（2）恢復速度慢，不能在注射后立即蘇醒，還需要使用逆轉劑（解藥）來解除麻醉狀態；（3）無法精確控制麻醉深度；（4）對心率和呼吸速度都有顯著的改變；（5）腹腔注射時還可能因為入針失誤而誤傷內臟。